愛輝歷史陳列館始建于1975年，2000年9月改擴建，2002年6月15日新館落成對外開放。2010年4月提升改造工程啟動，2011年6月提升改造工程完工。愛輝歷史陳列館現占地12萬平方米，展廳面積4600平方米。以遺址、建筑、陳列三位一體，互補強化，交相輝映，充分體現強烈的愛國主義主題。
遺址歷史內涵豐富、獨特。主體建筑造型別具匠心，寓意深刻。館舍西圓東方，方圓一體象征國土完整，但一個三角形大臺階將館舍一沖為二，寓意“刀劍”割裂了國土；臺階東側是“黑龍江——母親河”大型浮雕墻，展現著黑龍江流域古代民族生產、生活的情景；西側是風鈴墻，懸掛著1858個風鈴，寓意警鐘長鳴，勿忘1858年《璦琿條約》割地之恥；風鈴墻下的小廣場豎立著一座銅雕：一位母親抱著已死去的女兒，寓意祖國失去了兒女，失去了國土。半景畫館大樓頂端建有看臺，可見愛輝古城遺址全貌，滾滾東流的黑龍江和隔江對岸的“江東六十四屯”，令人回味無窮……
陳列內容設計采用編年與專題相結合的體例，分為五部分。第一部分“黑龍江是中國北方民族的母親河”，首次展出了諸多黑龍江畔中國一側采集、出土的精美石器、遼金文物，吸納了近年俄羅斯遠東地區(qū)石器時代和我國黑龍江中下游漢魏時期的考古研究成果，更有力地證實古代黑龍江流域與中原密不可分。第二部分“十七世紀的中國黑龍江流域和中俄《尼布楚條約》”中，首次公開展出了珍貴的鄂倫春民族薩滿服、神像、神偶，充分利用俄羅斯十七世紀原始檔案資料、學術著述和形象資料，展現、復原相關歷史。第三部分“十七世紀末至十九世紀中葉的中國黑龍江流域”，除利用我國檔案、學術成果之外，還新收集、利用了多幅日、俄文圖像資料。第四部分“十九世紀下半葉的中國黑龍江流域和中俄《璦琿條約》”中，簽訂《璦琿條約》的復原場景，是嚴格按清代檔案記載和俄文記述來進行設計，并展出有俄國“1858年紀念牌”等極具說明性的實物。第五部分“庚子俄難和重建愛輝”中，愛輝軍民抗俄使用的帶有“吉林”字樣的子彈、長矛為一級文物，俄軍使用的槍、刀、屠殺海蘭泡和江東六十四屯居民的照片均為首次展出。“海蘭泡半景畫”的畫面內容則是根據眾多中、俄、日、英文資料綜合研究后的最新學術成果。
展示設計中以諸多新發(fā)現的歷史照片、珍貴的檔案資料、富有特色的文物精品為主，輔以油畫、沙盤、寫實雕塑場景、大型開放式場景、半景畫等多種展示手段和地面互動投影等客觀、形象、生動地再現了歷史。
